水庫整體庫底北高南低，最大蓄水深度8.5m。庫底與邊坡全部用復合土工膜防滲，其中每個水庫有進水和出水建筑物各一個，混凝土進水、出水池。壩坡設有防滑槽，壩坡土工膜上鋪設沙礫反濾料并用現澆混凝土進行二次防滲覆蓋，庫底是覆土回填覆蓋。

壩坡防滑槽的開挖、壩坡坡面的清理、庫區平整碾壓下作。耿莊水庫原址是一片防沙樹林，高寒地區樹木扎根較深，復合土工膜鋪設前應清除一切樹根、雜草。主要施工方法為用機械將土方外運后，人工清理樹根，如有樹根全部挖出并鋪撒白灰。由人工清理樹根后整面鋪撒生石灰防止樹根再生長。

在保證鋪設面平整，并排除鋪設工作面范圍內的所有庫底積水，確定壩坡防滑槽的斷面開挖尺寸后，經驗收合格，達到鋪設復合土工膜條件。

做下料分析，根據實際平臺問出復合土工膜鋪設順序和裁剪圖。斜坡方向水平滾鋪，坡面鋪設在坡面驗收合格后，從壩頂向壩腳沿垂直與壩軸線方向緩慢展鋪到壩腳處形成與平臺鋪設的復合土工膜丁字形連接。裁剪復合土工膜之前，應根據相應規劃圖，結合現場實際情況，測量鋪設的實際尺寸，再按照復合土工膜搭接寬度10 cm留足搭接量，然后裁剪下料。