一旦水庫底部的防滲結構受損，就會出現滲漏通道，垃圾滲濾液沿著滲漏通道流向地下水導流層，污染地下水。這樣地下水只有經過污水處理達到排放標準后才能排放，會增加污水處理的負荷和成本。水庫底部滲漏主要有三個原因。一種是垃圾填埋場在穩定化過程中，由于垃圾降解速率不同，容易產生局部不均勻沉降，導致水庫底部防滲結構撕裂或穿孔；其次，填埋場運行過程中，垃圾進入場地的運輸、卸載、攤鋪、壓實、覆蓋等操作不規范，與防滲結構過于接近，導致防滲結構受損；第三，水庫底部防滲結構施工存在施工質量缺陷。水庫底部的滲漏往往說明地下水受到了污染，所以水庫底部的地下水就成了填埋場運行的“晴雨表”。